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Cell开创性研究图解单个细胞奥林巴斯显微镜和单个胚胎的染色质结合蛋白

标签:开创,开创性,研究,图解,单个,细胞,奥林,奥林巴斯  2019-4-10 9:01:44  预览

  

生物转达道:来自美国匹兹堡大门生命科学学院,麻省大学医学院的研究人员行使一种开创性新方法:uliCUT&RUN绘制了少量细胞奥林巴斯显微镜(包括单细胞奥林巴斯显微镜)和单个植入前胚胎的染色质上转录因子和DNA结合蛋白图谱。

这一研究成果宣布在4月4日的Cell杂志上,由美国匹兹堡大门生命科学学院的Sarah Hainer和麻省大学医学院的Thomas G. Fazzio向导完成。

CUT&RUN是一种类似于广泛使用的染色质免疫沉淀(ChIP)技术的方法,这种方法能确定染色质上的蛋白质定位。然而网站制作费用,目前用于DNA结合蛋白的全基因组作图方法必要数万,甚至数百万个细胞奥林巴斯显微镜,因此在体内完成DNA结合蛋白的作图十分受限——很多生物学紧张意义的细胞奥林巴斯显微镜群中的细胞奥林巴斯显微镜数量都不大。

CUT&RUN最初于2017年得以改善,可以成功应用于1,000多个细胞奥林巴斯显微镜群。在最新研究中百度关键词,Hainer和Fazzio试图进一步改进这项技术,终于首次成功在单细胞奥林巴斯显微镜和单个植入前小鼠胚胎中完成了全基因组作用因子的图谱。

他们将这种技术命名为超低输入CUT和RUN(ultra-low input CUT&RUN,uliCUT&RUN),实验证实,在大多数细胞奥林巴斯显微镜中只有一小部分转录因子结合位点被占有,因此证明了多细胞奥林巴斯显微镜实验所进行的检测,而且研究还注解,uliCUT&RUN可以检测转录因子与细胞奥林巴斯显微镜发育或疾病奥林巴斯显微镜关键有数细胞奥林巴斯显微镜群的结合。

“通过将定位研究推进到单细胞奥林巴斯显微镜和单个胚胎水平,将来的研究可以聚焦于细胞奥林巴斯显微镜异质性和有限生物样品的研究,”Hainer说,“通常,组织样品中细胞奥林巴斯显微镜数和细胞奥林巴斯显微镜纯度之间的平衡,会不利于ChIP-seq分析纯化组织特异性细胞奥林巴斯显微镜群。 而uliCUT&RUN从50个细胞奥林巴斯显微镜中获得因子结合图谱的能力与高细胞奥林巴斯显微镜数的图谱高度重叠,因此几乎可以从任何可用的样本进行绘图。”

原文题目:

Profiling of Pluripotency Factors in Single Cells and Early Embryos

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(19)30276-4