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Nature一种简单的血液检测方法,检测七种不同的癌症

标签:一种,简单,血液,检测,方法,七种,不同,不同的,癌症  2019-5-30 10:47:55  预览

  

生物转达道:约翰霍普金斯医学院Kimmel癌症中心的研究人员开发出了一种简单的血液检测新方法,通过分析癌细胞奥林巴斯显微镜脱落的DNA碎片中独特的模式,可以检测出7种不同类型癌症的存在。

这一研究成果宣布在5月29日的Nature杂志上。

研究证实,这种被称为DELFI的方法通过评估早期拦截的DNA片段,可以正确地检测来自208名美国,丹麦和荷兰地区,患有不同阶段乳腺癌,结肠直肠癌,肺癌,卵巢癌,胰腺癌,胃癌或胆管癌患者体内57%至99%以上的血液样本中的癌症DNA的存在。

这种方法在215名健康奥林巴斯显微镜人的血液样本测试中检测体现,仅在4例病奥林巴斯显微镜例中错误识别癌症。DELFI采用了一种人工智能来识别癌症患者血液中DNA片段的非常模式。通过研究这些模式,研究人员透露表现,他们可以在高达75%的病奥林巴斯显微镜例中识别癌症的起源组织。

用于癌症检测的所谓的无创检测,即“液体活组织检查”通常会是探求突变,这些突变是癌细胞奥林巴斯显微镜内DNA序列或甲基化的转变,但是并非所有癌症患者都能行使这些方法检测到转变,因此特别很是必要改进早期的癌症检测方法。

DELFI采取了一种不同的方法网站建设公司,通过分析血液中来自基因组不同区域DNA的大小和数量,研究DNA被包装在细胞奥林巴斯显微镜核内的体例。

文章作者,约翰霍普金斯医学院Alessandro Leal博士诠释说,健康奥林巴斯显微镜细胞奥林巴斯显微镜的细胞奥林巴斯显微镜核将DNA包装成一个组织优秀的“行李箱”,其中基因组的不同区域被警惕地放置在不同的隔间中。相比之下,癌细胞奥林巴斯显微镜的细胞奥林巴斯显微镜核更像是紊乱无章的“手提箱”,整个基因组中的“物品”被随意摆放。

“因为种种缘故原由,癌症基因组在包装体例上变得紊乱无章,这意味着当癌细胞奥林巴斯显微镜死亡时,它们会以紊乱的体例将DNA释放到血液中,”文章作者活动策划,Jillian Phallen博士说, “通过检查cfDNA,DELFI根据包装体例检测基因组不同区域的DNA大小和数量非常,帮助确定癌症的存在。”

不过研究人员也透露表现,这种方法还必要进一步验证,一旦经过验证,那么就可以从个体采集一管血液,提取cfDNA,研究其基因序列和确定碎片特性来筛查癌症。然后可以未来自个体的全基因组片段化模式与参考群体进行比较,确定该模式是否可能是健康奥林巴斯显微镜的或源自癌症。

文章通信作者,肿瘤学副教授Robert B. Scharpf博士说,由于全基因组的碎片模式可能揭示出与特定组织相关的差异,这些模式可以指出癌症的来源,例如来自乳腺癌,结肠癌或肺癌。

而且DELFI还可以同时分析基因组中数百到数千个区域的数百万个序列,从细小的cfDNA数量中识别肿瘤特异性非常,Scharpf说。

使用DELFI,研究人员发现癌症患者和健康奥林巴斯显微镜个体之间的全基因组cfDNA片段化分布不同。 在癌症患者中,cfDNA中的碎片模式好像是由血液和肿瘤细胞奥林巴斯显微镜释放的DNA混合物引起的,表现出多种不同的基因组差异。

在最新研究中,约翰霍普金斯的研究人员与来自丹麦和荷兰的其他研究人员合作,对来自208名癌症患者的cfDNA进行低覆盖率的全基因组测序,其中包括54名乳腺癌患者,27名结肠直肠癌患者,12名肺癌患者,28名卵巢癌患者,34名胰腺癌患者,27名胃癌患者和26名胆管癌患者。他们还进行了全基因组测序,分析215名健康奥林巴斯显微镜个体的cfDNA。

总体而言,研究人员报告说,健康奥林巴斯显微镜个体具有相似的碎片特性,而患有癌症的患者具有更多可变的碎片特性,不太可能匹配健康奥林巴斯显微镜的特性。

因为这种方法易于管理,而且简单廉价,研究人员预计它最终可能比其他癌症筛查测试(包括其他当前的cfDNA测试)更具成本效益。

(生物通:万纹)

原文题目:

Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with cancer